自然科学部では，爬虫類や両生類（トカゲ，イモリ，ヤモリ，カメレオン，カメ等）の飼育，３Dプリンタを用いて設計したモデルの印刷，天体観測で星の撮影，化学実験など幅広い科学の活動を行っています。また，夏や冬には合宿を行っています。現在は，高等学校文化連盟自然科学専門部主催の大会や大学主催の研究コンテストに参加を目指して研究を開始しています。興味のあることを追究することができる部活動です。